eDNA meetodi väljaarendamine (krüptiliste) võõrliikide varajaseks tuvastamiseks
Panksep, Kristel; Kisand, Veljo; Vasemägi, Anti
Loading
Name | Size | Description |
---|---|---|
2_4_1_edna_meetodi_valjaarendamine_kruptiliste_voorliikide_varajaseks_tuvastamiseks_aruanne_final.pdf | 2.214Mb |
Abstract
Läänemere seire üldine eesmärk on hinnata looduslike ja inimtekkeliste survetegurite mõju ja ulatust
Läänemere keskkonnale ja elustikule. Mereseire allprogrammi rannikumere seire osana teostatakse ka
võõrliikide seiret, mille eesmärgiks on hinnata võõrliikide arvukust ning levikut ning nende mõju
Läänemere ökosüsteemile. Samuti on eesmärgiks uute võimalike võõrliikide varajane tuvastamine
(https://www.keskkonnaagentuur.ee/et/seire). Traditsiooniliselt põhineb võõrliikide seire isendite
püüggil ja vaatlusel, mille käigus morfoloogiliste tunnuste alusel määratakse proovidest liigiline
koosseis, arvukus ja biomass. Töö on mahukas ja aeganõudev ning liikide täpne määramine nõuab
kogemustega eksperdi oskusi. Seetõttu suudetakse traditsiooniliste seiremeetoditega vajaliku
sageduse ja tihedusega katta vaid väikest osa Eesti rannikumerest. Järjest enam on hakatud
traditsiooniliste seiremetoodikate kõrval välja arendama ja kasutusele võtma innovaatilisi meetodeid
võõrliikide varajaseks tuvastamiseks keskkonnas. DNA-põhised meetodid liikide tuvastamiseks ja
identifitseerimiseks on oluliselt suurendanud teadlaste võimekust aja- ja kulutõhusalt hinnata
maismaa-, magevee- ja mereökosüsteemide bioloogilist mitmekesisust (Bruce et al., submitted).
Meetodite standardiseerimiseks on rahvusvahelisel tasemel tehtud suuri pingutusi, mis võimaldavad
juba praegu DNA põhiseid meetodeid integreerida tavapärastesse monitooringupragrammidesse,
sealhulgas ka võõrliikide ja ohustatud liikide seiresse (Hänfling et al., 2016) Bruce et al., submitted).
Näiteks on Euroopa teaduse ja tehnoloogia valdkonna koostöö programmi COST Action DNAqua-net
konsortsiumi liikmete poolt väljatöötamisel DNA põhise monitooringu standardid bioloogilistele
kvaliteedielementidele liitmaks need EL Veepoliitika ja EL Merestrateegia raamdirektiivi (2000/60/EÜ
ja 2008/56/EÜ).... Show more Show less
Keyword
eDNA; võõrliikide tuvastamine; keskkonna DNA; qPCR meetod; sekveneerimine; van Dorni batomeer; praimer; metatriipkoodistamineItem type
ReportCollections
The following license files are associated with this item: